Isti programi za nadzor lahko postanejo orodje zlorabe, ko do telefona pride oseba brez dovoljenja lastnika. Če ima fizični dostop do naprave, lahko takšno aplikacijo namesti in jo uporablja za prikriti nadzor nad dogajanjem na telefonu.
Po strokovnih ocenah so aplikacije za nadzor nastale za povsem legitimne namene, kot sta starševski nadzor nad družinskimi telefoni ali upravljanje službene opreme v podjetjih. V razpravah o varnosti mobilnih naprav so zato vse pogosteje v središču prav ta orodja.
Za omejevanje tveganj ima večina naprav z operacijskim sistemom Android vgrajen varnostni sistem, ki nameščene aplikacije sproti analizira in išče vzorce potencialno nevarnega vedenja. Uporabniki se lahko dodatno zaščitijo tako, da redno pregledujejo seznam nameščenih programov in pozorno spremljajo opozorila varnostnega sistema, saj tako hitreje zaznajo morebitne sumljive namestitve.