Klimatska naprava sama po sebi po navedbah strokovnjakov ni škodljiva. Nepravilna uporaba pa lahko poslabša kakovost spanca in udobje v spalnici.
Nastavitev klime na 21 ali 22 stopinj Celzija že pred spanjem pomeni, da se prostor med nočnim padcem zunanje temperature preveč ohladi. To telo dodatno obremenjuje. Priporočajo uporabo časovnika ali nočnega načina delovanja, pri katerem se naprava samodejno izklopi približno uro ali dve po tem, ko uporabnik zaspi.
Posebej opozarjajo tudi na redno čiščenje filtrov. Če vzdrževanje odpade, naprava po prostoru raznaša prah, cvetni prah in druge alergene, kar lahko povzroča ali stopnjuje težave z dihali pri občutljivejših posameznikih.